中国科学技术信息研究所“中国科技论文统计结果发布会”于2004年12月7日举行。会上公布了“第三届中国百种杰出学术期刊”名单，《北京大学学报（医学版）》名列其中。 中国科学技术信息研究所每年出版的《中国科技期刊引证报告》定期公布中国科技论文与引文数据库（CSTPCD）收录的中国科技论文统计源期刊的十余个科学计量指标。1999年开始，以此指标为基础，研制了中国科学技术期刊综合评价指标体系。采用层次分析法，由专家打分确定了重要指标的权重，并分学科对每种期刊进行综合评定。2002年公布了第一届中国百种杰出学术期刊名单。两年来先后以期刊评估为主题召开了十余次不同学科、不同层面的专家研讨会。2004年11月再次召集专家，综合分析了期刊指标体系实施以来我国科技学术期刊的变化趋势和实际状况，对期刊的指标权重进行了重新核定，在此基础上推出了第三届中国百种杰出学术期刊。