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体验AI药物研发,感受创新技术力量——北大附中师生赴北大化学学院参访学习

发布时间:2024/07/13 信息来源:附属中学 编辑:晏如 责编:安宁

北京大学-北大附中大中贯通课程“生命的化学”是一门贯通大学与中学资源和理念、以发展中学生科学素养为宗旨的跨学科选修课程。课程以生物学和化学为核心学科,在本轮课程实践中引入了信息技术与通用技术课程内容,设计了项目式的学习方式,通过模拟真实的药物设计,为学生搭建了“生物学+化学+信息技术+通用技术”的跨学科学习框架,帮助学生发展科学与技术素养、提高创新意识,助力其成长为具有国际视野和创新素养的领军人才。

在“生命的化学”课堂上,附中同学们模拟了药物设计的主要过程,自主选择了病原体,绘制了其生活史并选择了潜在药物靶分子,使用PDB或AlphaFold获取了靶蛋白结构,筛选了潜在药物分子。为了进一步对潜在药物分子进行结构优化,体验AI技术带给药物研发领域的变革,“生命的化学”课程师生一行来到北京大学化学与分子工程学院AI药物研发实验室进行了参访学习。

行前,化学学院来鲁华教授、前沿交叉学科研究院定量生物学中心裴剑锋研究员与北大附中任课教师唐灵芳等一起为同学们设计了详细的参访方案,并带领多名化学学院博士研究生做了精心准备。

化学学院孙琦副研究员带领同学们参观了实验室,向同学们介绍了实验室的研究概况以及实验环境。裴剑锋和博士生助教李亦博为同学们讲解了AI药物研发的价值、原理与实践方法。通过老师们深入浅出的讲解,同学们了解到传统药物研发周期长、成本高,而AI可以显著缩短药物筛选和优化的时间、加快新药上市速度;同时,通过精确的数据分析和预测,AI可以减少实验研发失败的风险。

孙琦为同学们介绍实验室的研究概况及实验环境

裴剑锋与博士生助教为同学们讲解AI药物研发的价值、原理与实践方法

博士生助教解答附中同学的提问

在实践环节,同学们分成了四个学习小组,每组由两位博士生助教指导进行AI药物设计实践。同学们使用NextChat等AI工具辅助选择潜在药物靶点;使用由来鲁华和裴剑锋实验室开发的CavityPlus等AI工具对靶蛋白进行结构域分析;使用逆合成平台ASKCOS体验化学小分子药物的合成路线设计与自动化合成。一个半小时的课程实践,同学们意犹未尽,收获满满。

裴剑锋及团队成员指导同学们分组进行AI药物设计实践

在后续的“生物的化学”大中贯通课程中,北大化学学院博士生助教彭陆鑫还将来到北大附中课堂,继续指导同学们使用相关软件对筛选的药物分子进行结构优化。希望本次以AI药物研发为主题的参访学习能在同学们心中播下创新的种子,指引他们将来成长为创新型科技人才。

裴剑锋及团队成员与附中师生合影留念

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